Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms