Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 243.7 ms