Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai1Q02085 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms