Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cacna1cQ01815 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms