Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms