Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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