Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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