Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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