Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P58686 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P58686 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P58686 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P58686 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P58686 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P58686 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P58686 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P58686 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P58686 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P58686 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P58686 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P58686 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
P58686 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P58686 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P58686 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
P58686 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms