Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms