Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms