Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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