Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01853 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01853 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01853 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01853 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01853 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01853 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01853 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01853 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01853 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01853 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01853 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01853 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01853 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01853 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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