Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxq1O70220 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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