Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms