Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms