Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 252.4 ms