Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms