Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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