Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms