Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clip2Q9Z0H8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms