Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Wdr54Q9R0D8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Wdr54Q9R0D8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Wdr54Q9R0D8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms