Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms