Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms