Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms