Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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