Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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