Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms