Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pard3bQ9CSB4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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