Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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