Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms