Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms