Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Vmp1Q99KU0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Vmp1Q99KU0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Vmp1Q99KU0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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