Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin3bQ91ZU9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3bQ91ZU9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms