Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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