Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms