Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Usp1Q8BJQ2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp1Q8BJQ2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp1Q8BJQ2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp1Q8BJQ2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms