Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifna12Q80SS5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms