Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms