Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Cnot7Q60809 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Cnot7Q60809 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Cnot7Q60809 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot7Q60809 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot7Q60809 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot7Q60809 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot7Q60809 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot7Q60809 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot7Q60809 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot7Q60809 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot7Q60809 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms