Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms