Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms