Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ttll12Q3UDE2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms