Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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