Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms