Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hoxd13P70217 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hoxd13P70217 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hoxd13P70217 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hoxd13P70217 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hoxd13P70217 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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