Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
LmnaP48678 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms