Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms