Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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