Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sept1P42209 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms